mirtarbase数据库

介绍
miRNAs (microRNAs) 是一类小的非编码 RNA 片段,可以通过与 mRNAs 的结合来调控靶基因的表达。mirtarbase 是一个包含已知关于 miRNA 靶标分子的所有实验验证文章的在线数据库。至今为止,它是已知最全面的 miRNA 靶标信息数据集。
数据来源
mirtarbase 数据集的靶标信息来自实验验证的文献。数据库的组成人员通过在已公开发表的论文中进行筛选,筛选并收集实验验证 miRNA 靶标信息。
数据提供的信息
mirtarbase 数据库为研究人员提供了 miRNA 和靶标的信息,其中包括miRNA 和靶标的序列信息以及调控的机制、靶标的 mRNA、PUB MEd ID 和表达的信息等。
数据库的应用案例
mirtarbase 得到了广泛应用。例如,研究人员利用 mirtarbase 验证了某个假设:miRNA-185-5p 对某个靶标表达的负向调控作用可以抑制癌细胞的增殖。其他的应用案例包括靶标预测、miRNA 及相关蛋白质功能的分析和与疾病相关的 miRNA 的研究等。
总结
mirtarbase 是一个已知最全面的 miRNA 靶标信息数据集,旨在为研究人员提供可靠的数据支持。利用这个数据库研究人员可以对 miRNA 及其靶标及其调控机制和相关生物过程作进一步的研究。该数据库的持续更新和完善也将有助于在生物医学和基础研究领域发现更多有意义的信息。

