targetscan数据库

介绍

TargetScan是一个广泛使用的数据库，用于推断microRNA（miRNA）与mRNA之间的相互作用。它可以预测miRNA对靶基因的调控作用，从而在研究中有重要的应用。

数据库结构

TargetScan数据库建立了miRNA与mRNA的相互作用网络，这个网络包括神经元、转录因子和信号转导的调控。这些网络构建了一种机制，可以解释miRNA如何在细胞生长和发育、衰老和癌症等方面发挥重要作用。

数据来源

TargetScan数据库的数据来源主要有三个方面：miRBase，UniProt和Ensembl。通过将这些数据综合起来，TargetScan可以提供全面的miRNA靶向基因信息。

分析工具

TargetScan提供的分析工具具备以下功能：预测目标gene的能力、确定一个特定的基因是否是一个给定的miRNA的直接目标、预测不同的基因的miRNA靶向性和比对多个miRNA的预测结果。

应用

TargetScan数据库的应用相当广泛。例如，它可以用于研究miRNA在抗菌药物、神经损伤和肿瘤发生方面的作用；还可以提供miRNA靶向基因的信息，从而在基因诊断和治疗中有重要的应用。